台军最初共设有18支特种作战部队，但后采遭到裁撤，特种部队只剩下3支，即除了台湾警方维持治安的特勤队之外的陆军空降特勤队、海军陆战队特勤队、宪兵特勤队3支特种作战部队，其代号分别为“凉山特勤队”、“黑衣特勤队”和“夜鹰部队”。

    3支特种部队在平时主要担负“反劫持、反暴乱、反破坏、反渗透”等反恐特种勤务，在战时则进行“空降、渗透、袭扰、爆炸、破坏、捕俘”等特种作战任务。其中，空降特勤队主要是以空降方式渗透到对方纵深，执行渗透、突击、破坏与侦察等任务，以及配合其它部队的撤退或突击。此外，还要担负陆军特战任务及防范重大突发事件。

    台海军陆战队特勤队又分为“天威”部队、“海龙”蛙人部队和两柄侦察大队等，主要执行在外岛打击恐怖主义和走私活动，以及战前渗透到对方战区获取情报，对敌方要目标进行渗透攻击等任务。同时，也负责台湾南部地区的特勤任务以及台湾海域反劫船任务，另外也要奉命执行陆战队特战任务及应对重大突发事件。“海龙”蛙人部队，主要负责金门、马祖、东引及澎湖地区的特勤任务，同时也执行海上巡逻、查缉走私、偷渡、离岛运输补给等特战任务。

    宪兵“夜鹰特勤队”的主要职责为维护社会治安，由“国防部”直接命令支援其他警务人员无法完成的任务，如对偏远山区的非法武器、毒品仓库或工厂进行搜查，对重大劫持案件进行快速反应等。此外，该部队还负责台湾北部反恐任务，保护机场与核电厂安全及防范重大突发事件。

    除上述任务外，台军特种部队往往还要承接一些“国际交流”活动，如为“驻外单位”提供安全支援，代训“友好邦交国”部队，与其它国家或地区的特种部队进行交流等。但由于屡遭裁撤，作战能力已明显不足。

    “精进案”后，台军特种作战部队重新扩编，总兵力达5000-7000人，数量约占台正规军的1％，具备陆海空、远中近特种作战能力。根据台湾的地理环境和作战任务，台军共编组了16支特种部队，包括3支“甲种特勤队”——空降特勤队、陆战队特勤队、宪兵特勤队，海、陆、空三军部队的“乙种特战单位”和警方的特勤队。台空军编有航空特种作战司令部、空降特种作战部队训练中心各1个；海军编有两栖侦察搜索大队、三栖水下爆破大队、海军陆战特勤队各1个；陆军编有1个3000人的特种作战旅，下辖3个特战营(乙型基干特战营、基干特战营、特战支援营)，旅直属通信连、搜索连、工兵排、宪兵班等。

    台军特种作战部队在平时实施统一集中指挥，战时隶属战区司令部指挥并接受联合特种作战司令部领导，驻金门、马祖等外岛的特种作战分队隶属于“防卫部”。在实施反空袭、反封锁和反登陆作战之前，特种作战部队通常编成若干个特种小队，搭乘直升机或舰艇渗入对方沿岸或浅近纵深执行破袭任务，驻守金门、马祖等外岛的两栖侦察营有时编成数个特种作战组，于战前或战中秘密抵达对方沿岸遂行渗透骚扰及情报侦察等任务，根据作战的规模、性质、任务和环境，临时组建与之相适应的不同规模的作战单元。

    台军认为，特种作战编组应遵循“小而精、功能全”的原则，根据任务灵活组织，以便于机动和隐蔽行动企图，使敌方防不胜防，既适应特种作战的需要，又在作战中充满活力。在台军新一轮的军事改革中，一项重要内容就是调整军队的组织结构，向小型、精干、灵活、高效、多能的方向发展，这种编组将更有利于特种部队与常规部队的配合使用。（军事文摘）