中华人民共和国驻菲律宾大使馆3月13日在马尼拉发表声明说，中国决不接受菲律宾众议院东盟和亚太小组委员会正在拟议中的《对台互惠关系法》。
中国大使馆发言人在一项声明中说，这个法案的实质是将台湾当作“国家”看待，同台湾保持官方或官方性质的往来，以使菲律宾同台湾之间现存的关系升级。
声明强调说，这个法案违背了中菲建交联合公报所确定的原则，也违反了科·阿基诺总统颁发的三一三号行政命令。
声明说，我们希望提出这个法案的少数议员以中菲友谊的大局为重，撤回《对台互惠关系法》草案，不要做伤害中国人民感情和妨碍菲律宾人民基本利益的事情。
菲律宾众议院东盟和亚太小组委员会是3月9日同意讨论《对台互惠关系法》草案的。
在3月10日的新闻公报中，菲外交部发言人弗莉佩·马比兰甘说，菲外交部反对这一法案，因为这一法案与菲政府坚持的“一个中国”的政策不一致，将构成对菲中两国良好关系的威胁。
菲律宾外交部长劳尔·曼格拉普斯3月13日也向新闻界发表声明说，“我们坚持不赞成《对台互惠关系法》的立场”。他说，“为了推行我们承认北京作为全中国政府的成功政策，没有必要制订对台关系法。我们赞成加强同台湾之间人民对人民的关系”。
外交部发言人李肇星3月16日在北京说，菲律宾议会正在讨论的《对台互惠关系法》草案违背了中菲建交联合公报所确定的原则，也违反了科·阿基诺总统颁布的三一三号行政命令。
在当天下午的新闻发布会上回答记者提问时，这位发言人说：“我们注意到菲律宾政府一再重申奉行‘一个中国’的政策，菲外长曼格拉普斯也已对《对台互惠关系法》问题作了明确表态，我们对此表示赞赏。”他指出，中国反对任何同我国建立外交关系的国家同台湾发生官方往来。对一些国家同台湾发生民间的贸易往来，中国一般不持异议。
李肇星希望提出这个草案的少数议员以中菲友谊大局为重，撤回《对台互惠关系法》草案，不要做伤害中国人民感情和妨碍菲律宾人民基本利益的事。
