民进党党主席苏贞昌为"三合一"败选下台之后，民进党中常会12月7日下午通过吕秀莲为代理党主席。吕秀莲一接下民进党代理主席，马上在政坛展现锋芒。她不但高分贝批判高捷，还宣布要组民间监督联盟；在谢长廷“内阁”最脆弱的时候，吕秀莲下了重手，让民进党内局势更加混乱。不仅如此，吕秀莲许多积极的言行让陈水扁相当不以为然。特别是吕秀莲前日公开表示，她是在替“总统”看守党中央，这番话让阿扁动怒了。

   代理民进党主席动作多 扁骂吕秀莲得寸进尺

   隐忍了好几天，陈水扁终于在12月11日忍不住发飙，他称，对于代理党主席，他从来没有指派谁代理党主席；对吕秀莲代理一事，他事前根本不知情，怎么可能会传出支持吕秀莲的话？于是立刻告知几位核心人士，取消周一、也就是12日的例行“扁吕会”。陈水扁用闽南话告诉身边的人说，“这根本就是把阿扁吃够够”（意为得寸进尺）。这么大动作，算是这6年来首度对吕秀莲出重手。>>详文

   陈水扁对吕秀莲发飙别有用心  

扁面临跛脚的困境：民进党败选后首度中常会推举代理党主席，陈水扁属意的民进党“立院”总召赵永清未获推选，而由吕秀莲接下选后党内大改革的重任。不少人形容，这是“春江水暖鸭先知”，拉开选后陈水扁在党内跛脚的序幕。>>媒体链接:吕秀莲接掌党机器 扁跛脚拉开序幕

扁选后一整个星期没有露面，民进党内群雄相争大戏日日更新，已进入准战国时代，每个人都想早一步卡到一个对自己最有利，最能削弱别人势力的位子。整个外在气氛看来，后扁时代眼看着似乎就要来了。>>八方言论：民进党内反扁势力崛起

不过，绿营要角们显然都太低估陈水扁的战斗力与坚定意志。扁必须承认他在"三合一"选举彻底失败，但失败并不代表他没有东山再起的机会。

   扁警告吕秀莲，就是杀鸡儆猴，警告“四大天王”别轻举妄动甚或想把自己塑造成“钦定接班人”，别那么轻易认定陈水扁真的跛脚了！

   说穿了，陈水扁的重点还是在“平衡”两个字。不愿意吕游苏谢任何一个人，过早冒出头来，即便出现结盟关系，都不是扁所乐见。

   陈水扁防跛脚采取两手抓

吕秀莲——故意安插她搅局。吕在民进党没有声望，人缘极差，她多年来独来独往，随兴而为，不善于也不懂得与团队合作。>>台岛夜话: 民进党没主席阿扁拱出吕秀莲

    游锡堃——游锡堃决定参选民进党主席后，刚辞去党主席的苏贞昌日前会见陈水扁时，曾建议由游锡堃参选党主席，“苏游结盟”态势相当明显。且游锡堃近日与陈水扁会面，相关人士认为，阿扁是授意游参选党主席。外界更传游锡堃已获得党内正义连线的支持。>>民进党主席之争浮上台面 陈水扁苏贞昌力挺游锡堃

    苏贞昌与谢长廷——随着"总统府秘书长"游锡堃参选党主席，陈水扁可能进行两手策略的安排，在苏谢两大接班势力中取得平衡。在党机器方面，透过与苏、新系合作，发挥影响力；在政方面，则是与谢或谢系人马维持合作关系。不过，一旦扁谢之间对"府院"权力分配谈不拢，谢必须离开"阁揆"之位，扁也可能让谢在政方面保有若干发挥空间，以维持合作关系。>>八方言论:苏谢两大接班势力 扁两手操控

留下谢长廷作“靶标”——陈水扁留下谢长廷是为了来挡“子弹”，以免自己直接暴露在密集的火力之下。扁在"三合一"开票后要暂留谢长廷是不争的事实；但他不满谢把暂留的"留"字拿来做文章，让他有被逼宫的感觉。