“民进党全国代表大会”为党的最高权力机构，每一年由中央执行委员会召集一次，主要职责是修改党纲、党章、选举或罢免中央执行委员会委员等。而中央执行委员会则是常设的权力机构，共有委员35人，包括党主席一人，中执委委员职务也是各派系争夺的焦点，委员中14人为常委。党主席为党员直选，任期2年，可连任1次。中央评议委员会有委员11人，对党的各项工作进行监督，有“全代会”选举产生。中央党部还下设国际事务部、中国大陆事务部、组织推广部、文化宣传部、社会发展部、妇女发展部、青年发展部、族群事务部等8个部，财务委员会、政策委员会等2个会，以及一个民意调查中心和一所“台湾民主学校”。民进党也在各地方设立海外党部、地方党部与基层组织。目前有党员约40多万。

    民进党现任领导人：

    主席：游锡堃

    秘书长：林佳龙

    副秘书长：林宜正  廖碧英

    中常委：吕秀莲、苏贞昌、游锡堃、叶菊兰、蔡同荣、苏焕智、谢长廷、陈胜宏、郑宝清、陈唐山、柯建铭、蔡宪浩、周清玉